Ja, du kannst damit auch andere Waffen verzaubern, nicht nur die Waffe, die als Strukturgeber fungiert.
Um den Strukturgeber benutzen zu können muss sie wissen, wie dieser funktioniert. Wenn die Magierin also nicht weiß, dass es sich um ein Strukturgeber handelt und den Stab auch nicht untersucht (i.e. Arkane Kunde mit Meisterschaft "Artefaktkunde"), dann wird sie das mit hoher Wahrscheinlichkeit nicht wissen und den Strukturgeber auch nicht einsetzen können.
Wenn sie weiß, dass es sich um einen Strukturgeber handelt und auch weiß, wie sie diesen einsetzt, dann tut sie das auch komplett bewusst.
Zu dem Schaden:
Wie in der Beschreibung steht, macht die Waffe 1 zusätzlichen Feuerschaden. Das bedeutet, dass nur der zusätzlicher Schaden auch Feuerschaden ist, der Rest ist normaler Schaden (das steht sonst in der Beschreibung drin, wenn der gesamte Schaden in elementaren Schaden umgewandelt wird).