Einfach mal weiter gebrainstormed - ist natürlich alles noch kein wasserdichter Plot:
Vielleicht ist es eine Fee, deren Wesen die Verwandlung ist. Sie macht aus Ware X dann Y, möglicherweise ist es für sie sogar eine Verbesserung, nur aus Menschensicht wird die Waren damit unbrauchbar. So das der "clevere" Händler dachte, er kann sie gut für seine Zwecke einspannen.
Was das für eine Verwandlung ist und welche Waren betroffen sind müsste man noch ausarbeiten. Schön fände ich den Ansatz, wenn eben nur bestimmte Waren / Karawanen betroffen sind, so dass das Problem eben auch nicht sofort augenfällig ist, weil viele unbehelligt den Pfad passieren.
Die Chars könnten im Vorfeld schon Gerüchte gehört haben, dass in letzter Zeit einige Karawanen Probleme hatten, weil die Waren kaputt gingen, aber (noch) niemand was genaues weiss. Vielleicht ist das gar der Grund, warum sie für eine Karawane angeheuert werden?
Wenn ihr es actionlastig mögt, wäre ein Überfall des Feenwesens der beste Weg. Vielleicht glauben sie auch zunächst siegreich zu sein und des Wesen erfolgreich zurückzuschlagen, stellen dann aber später fest, dass auch die Waren ihrer Karawane verwandelt sind - und müssen dem Wesen nachsetzen.
Wenn es eher mysterymäßig werden soll, könnte man den Kampf auch zunächst weglassen, die Gerüchte und Spuren entsprechend streuen und die Paranoia der Spieler hochtreiben, ihre eigenen Waren zu schützen. Bis sie dann die entscheidenden Hinweise finden und das Wesen aufspüren und stellen.